ГДС – Тематично направление 1
1. Прилагане на ДНК баркодиране за таксономично идентифициране на видове и проучване на популационната динамика
а/ ДНК баркодиране на растителни ресурси
Едно от научните направления на лабораторията е разработването на високо-ефективни молекулярни маркерни системи за изучаване на различни аспекти от растителното генетично разнообразие. ДНК баркодирането се прилага при различни биологични обекти като ефективен помощен методологичен подход за таксономично идентифициране на видове, както на ниво индивиди, така и за определяне на биологичен състав на смесени проби. Методът се прилага и за проучване на видовата динамика и взаимодействия на популационно ниво. Изследванията при растенията се провеждат основно върху растителни ресурси, представителни за българското биоразнообразие, със фокус върху ендемични и медицински растения за които липсва или е оскъдна информацията за генетично разнообразие.
На базата на ДНК баркод области от хлоропластния геном rbcL, matK, trnH-psbA и рибозомни участъци (като ITS), широкомащабни проучвания се провеждат върху представители от род Crocus (минзухар) и род Galanthus (кокиче). ДНК баркодирането се оптимизира и прилага и при други видове и семейства растения – род Centaurea, род Thymus (мащерка), род Sideritis, род Nepeta (котешка мента), Ludisia discolor (орхидея) и други. Интерес представлява разширяването на биологичните обекти с включване на микроводорасли, мед и прополис.
Прочетете повече:
Aneva I, Zhelev P, Bonchev G (2022) Sideritis elica, a New Species of Lamiaceae from Bulgaria, Revealed by Morphology and Molecular Phylogeny. Plants, 11, 2900. https://doi.org/10.3390/plants11212900
Aneva I, Zhelev P, Bonchev G et al. (2022) DNA Barcoding Study of Representative Thymus Species in Bulgaria. Plants, 11(3), 270, https://doi.org/10.3390/plants11030270
Petrova D, Gašić U, Yocheva et. al. (2022) Catmint (Nepeta nuda L.) Phylogenetics and Metabolic Responses in Variable Growth Conditions. Front Plant Sci. 13:866777. doi: 10.3389/fpls.2022.866777.https://doi.org/10.3389/fpls.2022.866777
Chaneva G, Tomov A, Paunov M et al. (2022) Jewel Orchid’s Biology and Physiological Response to Aquaponic Water as a Potential Fertilizer. Plants, 11, 3181. https://doi.org/10.3390/plants11223181
б/ Молекулярна идентификация и генотипиране на фитопатогенни гъби по културни растения.
– Изучаване на генетичното разнообразие на гъбните патогени от род Colletotricum, нападащи икономически важни култури в България.
Прочетете повече:
Manova V., Stoyanova Z., Rodeva R., Boycheva I., Korpelainen H., Vesterinen E., Wirta H., Bonchev G. (2022) Morphological, Pathological, and Genetic Diversity of Colletotrichum Species Pathogenic on Solanaceous Vegetable Crops in Bulgaria. Journal of Fungi, https://doi.org/10.3390/jof8111123
Rodeva R, Stoyanova Z, Manova V, Georgieva R, Stoilov L. (2016) Isolation and characterization of Colletotrichum coccodes from potato in Bulgaria. Acta Horticulturae, 1142, International Society for Horticultural Science (ISHS), 127-134. https://doi.org/10.17660/ActaHortic.2016.1142.20
Stoyanova Z, Rodeva R, Karov I, Kovacevik B, Manova V, Georgieva R. (2013) Morphological and molecular characterization of Colletotrichum coccodes isolated from pepper cultivated in Bulgaria and Macedonia. Matica Srpska Journal of Natural Sciences, 124, https://doi.org/10.2298/ZMSPN1324249S
– Изследване на молекулярната вариабилност на гъбни фитопатогени при пшеницата
